Une étude, dont les résultats intitulés «Visualizing the Molecular Recognition Trajectory of an Intrinsically Disordered Protein Using Multinuclear Relaxation Dispersion NMR» ont été publiés dans la revue Journal of the American Chemical Society, a permis, pour la première fois, de reconstituer en 3D à l'échelle atomique le parcours et les étapes successives du changement de forme d'une protéine virale désordonnée, de son état libre jusqu'à sa fixation sur une autre protéine virale.

Alors que «les protéines désordonnées, très courantes tant chez les eucaryotes que chez certains virus, interviennent dans des mécanismes biologiques déterminants et dans de nombreuses maladies infectieuses», les méthodes actuelles de la biologie structurale, comme la cristallographie, «ne prennent pas en compte leur flexibilité», qui «joue pourtant un rôle fondamental dans leur activité biologique».

Dans ce contexte, l'étude ici présentée «s’est intéressée aux mécanismes d’interaction entre deux protéines du virus Sendai, sachant que ce virus, qui appartient à «la famille des paramyxovirus pathogène chez le modèle murin» est proche des virus de la rougeole et des oreillons, pathogènes chez l'Homme.

Comme l'interaction des deux protéines étudiées, qui sont une nucléoprotéine (NT) et une phosphoprotéine (PX), «déclenche la réplication de l’ARN viral et provoque donc l’infection de l’organisme hôte», les différentes étapes du passage de la forme libre et flexible de NT jusqu’à son ancrage sur la surface de PX pour trouver le site d’interaction, ont pu être reconstituées avec une résolution atomique, en utilisant la résonance magnétique nucléaire (RMN).

Il est alors apparu concrètement que «le site actif de la NT libre adopte très rapidement différentes conformations», mais, «seule l’une d’entre elles, une hélice d’une longueur particulière, peut interagir avec PX».

Désormais, cette approche méthodologique, qui «permet de reconstruire en 3D le déroulé de nombreux mécanismes biologiques, et en particulier, de mieux comprendre le mode de fonctionnement des protéines désordonnées», va pouvoir «être utilisée pour le développement d’agents pharmacologiques agissant directement sur ces molécules, souvent impliquées dans des maladies humaines».