Une étude, dont les résultats intitulés «MetaHiC phage-bacteria infection network reveals active cycling phages of the healthy human gut» sont publiés dans la revue eLife, a permis de caractériser avec une précision sans précédent les réseaux d’interaction phages-bactéries du microbiote de dix individus sains. Plusieurs centaines de génomes de bactéries et de phages ont ainsi été détectés et les milliers d’interactions les liant ont été identifiées grâce à la quantification des contacts entre les molécules d’ADN des virus et de leurs hôtes.

Relevons tout d'abord que l'équilibre du microbiote intestinal humain, qui «se compose de centaines d’espèces bactériennes et de phages (des virus qui n’infectent que les bactéries)», est «crucial pour la santé». Dans ce contexte, la méthode employée dans cette étude «a l’avantage de fournir des données exhaustives à partir de très peu d’échantillons biologiques». Les données obtenues ont été analysés «avec des algorithmes semblables à ceux appliqués à l’étude des communautés d’individus sur les réseaux sociaux».

Au bout du compte, «la mise en lumière de ce panorama de relations entre bactéries et phages pourrait s’appliquer à des thérapies impliquant le microbiote intestinal, telles que la transplantation fécale et la phagothérapie». On peut remarquer, en outre, que l'approche utilisée dans cette étude «pourrait également déboucher sur des analyses plus précises des écosystèmes terrestres et marins».